Claude-dal térképezte fel az Anthropic a prokarióta vaultot

Mit találtak

Az Anthropic Science csapata közzétette az első 3D-szerkezetet egy olyan vault részecskéről, amely prokarióta/fág MVP-homológból áll össze. A vaultok 1986 óta ismertek eukariótákban, a funkciójuk továbbra sem bizonyított. A részletek a Intology Locus molekulakutató jellegű AI-labormunkához hasonlóan Claude-dal gyorsított laborfolyamatot mutatnak.

Számok és módszer

• L05 fágfehérje: 96 kópia, kb. 9,5 megadalton, 54×45 nm, kb. 25%-kal nagyobb belső térfogat a humán vaultnál.
• Kb. 15 milliárd fehérjét szűrtek; MVP-homológok 29 baktérium- és 4 archaea-törzsben, a fajok kevesebb mint 1%-ában.
• Méretkizárásos kromatográfiával a tisztítás kb. 90 perc, a hagyományos cukorgradiens helyett napok helyett.
• Első teljes modell cryo-EM-ből 34 óra alatt; a csapat saját hibáit is dokumentálta (két hetes protokollhiba, tükrözött térkép).

Korlátok

Eddig csak E. coliban állították elő a részecskéket, természetes gazdában még nem igazolták. A funkció továbbra is nyitott. A preprint a bioRxivra került, a struktúrákat később adják ki.